Convertidor online gratuito de NDPI a JPG

Qué es el formato NDPI

NDPI es un formato propietario de imágenes de portaobjetos completos creado principalmente por los escáneres Hamamatsu NanoZoomer. Puede contener imágenes de microscopía extremadamente grandes y multirresolución utilizadas en patología digital, investigación y archivado de portaobjetos.

Puede encontrar archivos NDPI en el software Hamamatsu NDP.view2, QuPath, Fiji/ImageJ con Bio-Formats y aplicaciones basadas en la biblioteca OpenSlide. Un archivo NDPI puede ocupar muchos gigabytes y puede incluir varios niveles de resolución, por lo que no equivale a una fotografía común de una sola capa.

Qué es el formato JPG

JPG, también llamado JPEG, es un formato de imagen rasterizada ampliamente compatible que utiliza compresión con pérdida. Es adecuado para vistas previas de portaobjetos, informes, presentaciones, sitios web, archivos adjuntos de correo electrónico y edición general de imágenes.

Los archivos JPG normalmente son mucho más pequeños que los archivos NDPI y se abren sin software especializado de microscopía. El formato no conserva la pirámide NDPI, los metadatos específicos del escáner, las anotaciones, los múltiples planos focales ni los datos de imagen diagnósticos.

Cómo convertir realmente NDPI a JPG

Usar el convertidor en línea

Puede convertir el archivo en 101convert.com de forma gratuita y sin instalar software. Cargue el archivo .ndpi, elija JPG como formato de salida, inicie la conversión y descargue la imagen resultante. Para portaobjetos muy grandes, utilice un método de escritorio o exporte una región más pequeña, ya que un JPG de resolución completa puede superar los límites de memoria o tamaño de archivo.

Exportar una vista previa del portaobjetos con OpenSlide y Python

OpenSlide está diseñado para leer formatos de portaobjetos completos, incluidos muchos archivos NDPI. Instale la biblioteca de sistema OpenSlide para su sistema operativo y, a continuación, instale los enlaces de Python y Pillow:

pip install openslide-python pillow

Guarde esto como ndpi_to_jpg.py y sustituya el nombre del archivo de entrada:

import openslide

slide = openslide.OpenSlide("sample.ndpi")
image = slide.get_thumbnail((6000, 6000)).convert("RGB")
image.save("sample.jpg", "JPEG", quality=90, optimize=True)

Ejecútelo con:

python ndpi_to_jpg.py

get_thumbnail() crea una vista previa del portaobjetos completo limitada a 6000 por 6000 píxeles. Aumente esas dimensiones para obtener más detalle, pero compruebe la memoria disponible antes de exportar imágenes muy grandes.

Exportar una región seleccionada de alta resolución

Para un área de tejido que deba conservar más detalle, lea una región en un nivel de pirámide elegido en lugar de convertir el portaobjetos completo:

import openslide

slide = openslide.OpenSlide("sample.ndpi")
region = slide.read_region((10000, 15000), 0, (4000, 3000)).convert("RGB")
region.save("region.jpg", "JPEG", quality=95)

Las coordenadas se miden desde la esquina superior izquierda en el nivel 0, que normalmente es la resolución más alta disponible. Cambie la ubicación y las dimensiones para que coincidan con el área de tejido necesaria. Las coordenadas del nivel 0 y los niveles disponibles se pueden consultar con slide.level_dimensions.

Usar QuPath o Fiji

QuPath puede abrir archivos NDPI compatibles mediante OpenSlide. Abra el portaobjetos, seleccione la vista o región necesaria y utilice File → Export images para exportar un JPG. En Fiji/ImageJ, abra el archivo mediante File → Open Samples o el importador de Bio-Formats y, a continuación, utilice File → Save As → JPEG. Los nombres de los menús pueden variar según la versión de la aplicación y los plugins instalados.

Calidad, compatibilidad y limitaciones

La exportación a JPG utiliza compresión con pérdida. Utilice un valor de calidad de aproximadamente 90–95 para uso general y evite abrir y volver a guardar repetidamente el mismo JPG. PNG o TIFF es preferible cuando se requiere análisis a nivel de píxel, anotaciones o conservación sin pérdida.

Un JPG del portaobjetos completo aún puede ser demasiado grande para algunos visores incluso después de la compresión. Exportar una miniatura o una región suele ser más compatible que convertir todo el portaobjetos en una sola imagen de resolución máxima.

No utilice un JPG como sustituto de archivo o diagnóstico de la fuente NDPI. Descarta la estructura multirresolución y puede introducir artefactos de compresión que afecten al detalle celular fino. Conserve el NDPI original y trate el JPG como una copia para presentación o uso compartido.