Convertidor online gratuito de VSI a PNG

El software de microscopía Olympus almacena las imágenes whole-slide en VSI, mientras que muchos editores de imagen, navegadores y sistemas de documentación aceptan PNG. La conversión del archivo produce una imagen raster portátil para compartir, anotar, usar en la web o editar de forma básica, pero puede representar solo una vista de slide seleccionada en lugar del dataset completo de múltiples resoluciones.

Qué es el formato VSI

VSI normalmente significa Virtual Slide Image, un formato propietario de microscopía whole-slide creado por software de Olympus, como cellSens, y visualizado con OlyVIA. Almacena imágenes de microscopía en múltiples resoluciones, normalmente como datos divididos en tiles, junto con metadata de adquisición.

Un dataset VSI puede incluir archivos .ets asociados que contienen datos de imagen. Mantenga el archivo .vsi y sus archivos complementarios en la misma carpeta; abrir solo el archivo VSI puede producir una imagen incompleta o un error de serie faltante. Si la extensión proviene de un software distinto de las aplicaciones de microscopía de Olympus, identifique primero ese origen, ya que VSI no es un formato universal de una sola finalidad.

Qué es el formato PNG

PNG es un formato raster sin pérdida y ampliamente compatible. Conserva los valores de los píxeles sin la pérdida generacional asociada con JPEG y admite transparencia, por lo que resulta adecuado para figuras, capturas de pantalla, anotaciones de slides, presentaciones y páginas web.

PNG no conserva la estructura del dataset VSI, la metadata de microscopía, los niveles de enfoque ni la pirámide de resolución. Un PNG convertido normalmente es un plano de imagen rasterizado o un campo de visión seleccionado.

Cómo convertir VSI a PNG

Uso de Fiji y Bio-Formats

1. Instale Fiji, que incluye el importador Bio-Formats, y conserve todos los archivos pertenecientes al dataset VSI en una misma carpeta.
2. Inicie Fiji y seleccione File → Open; después, seleccione el archivo .vsi. Si Fiji solicita utilizar Bio-Formats, acéptelo.
3. En Bio-Formats Import Options, seleccione la serie necesaria. Para un archivo whole-slide, elija el nivel de resolución o la región deseados en lugar de cargar el slide con la máxima resolución si la memoria del equipo es limitada.
4. Para una imagen completa o un área seleccionada, utilice las herramientas de recorte o selección de regiones de Fiji. Convierta la visualización a RGB mediante Image → Type → RGB Color cuando el resultado deba ser un PNG de color estándar.
5. Seleccione File → Save As → PNG y guarde el resultado con una extensión .png.

La exportación PNG desde Fiji generalmente guarda el plano de imagen activo. Si la importación abrió un stack, exporte el slice necesario o utilice un flujo de trabajo de secuencia de imágenes para varios planos; no espere que un único archivo PNG contenga el stack VSI original.

Uso del software de Olympus

Abra el dataset en OlyVIA o cellSens, seleccione la magnificación y la región necesarias y, después, utilice el comando de exportación de imágenes de la aplicación, que normalmente se encuentra en File → Export o File → Save As. Elija PNG y establezca las dimensiones o la resolución de exportación antes de guardar. Los nombres de los menús varían según la versión del producto de Olympus.

Conversión en línea

Puede convertir el archivo gratuitamente en el sitio web 101convert.com sin instalar software. Cargue el dataset VSI completo cuando el conversor solicite los archivos asociados; un archivo .vsi independiente puede no contener todos los píxeles de la imagen. La conversión en línea no es adecuada para datos confidenciales de pacientes o de investigación, a menos que las condiciones de gestión de datos del sitio cumplan sus requisitos.

Limitaciones de calidad y compatibilidad

Elija deliberadamente la resolución de salida. Exportar una vista general de baja resolución crea un PNG pequeño, pero elimina los detalles celulares finos; exportar un slide whole-slide con resolución completa puede crear una imagen muy grande que supere los límites de PNG, del navegador o de la aplicación.

PNG admite datos en escala de grises y RGB de 8-bit y 16-bit, pero los visores comunes pueden mostrar incorrectamente las imágenes de 16-bit o reducirlas a 8-bit. Para figuras de color habituales, RGB PNG es la opción más compatible. Conserve los archivos VSI originales cuando sean importantes la metadata, la calibración, los z-stacks, los múltiples planos focales o el reprocesamiento futuro.