Convertir CDX a PNG

Las estructuras de ChemDraw se exportan a PNG cuando un sistema de manuscritos, una presentación, una página web o un editor de imágenes necesita una imagen estándar en lugar de un documento .cdx editable. PNG también proporciona una representación fija para compartir diagramas químicos con destinatarios que no utilizan ChemDraw.

Qué contienen los archivos CDX

CDX es una extensión de archivo ambigua. Lo más habitual es que designe el formato binario nativo de ChemDraw y ChemOffice, utilizado para estructuras químicas, reacciones, anotaciones, etiquetas de átomos, estereoquímica y diseño de página editable. Conserve este archivo de origen porque mantiene los objetos químicos y la información del dibujo que PNG no puede preservar.

Un formato independiente y antiguo de dibujo comprimido de CorelDRAW también ha utilizado .cdx. Los archivos CDX de ChemDraw y CDX de CorelDRAW no son intercambiables, por lo que debe identificar la aplicación que creó el archivo antes de seleccionar un software o un servicio en línea.

Por qué se utiliza PNG

PNG es un formato rasterizado sin pérdida compatible con navegadores, software ofimático, sistemas de publicación y editores de imágenes. Admite transparencia y conserva las líneas finas de los enlaces, las cuñas, los superíndices y el texto con mayor nitidez que JPEG, cuya compresión con pérdida puede introducir artefactos visibles alrededor de los gráficos lineales.

PNG contiene píxeles en lugar de estructuras químicas editables. No conserva la conectividad molecular, los datos de estructura en los que se pueden realizar búsquedas, los metadatos de reacción ni las etiquetas editables.

Exportación de archivos CDX de ChemDraw

1. Abra el archivo en ChemDraw mediante File → Open.
2. Compruebe el diseño final previsto antes de exportar. Corrija las etiquetas de átomos recortadas, los objetos superpuestos, los límites de página y el grosor de las líneas de enlace en el tamaño de visualización final.
3. Utilice File → Export y seleccione PNG. El texto exacto de los menús y las opciones de exportación disponibles varían según la versión de ChemDraw.
4. Establezca las dimensiones de píxeles necesarias. Para una impresión colocada con un ancho físico conocido, calcule los píxeles multiplicando el ancho en pulgadas por los ppi requeridos; 85 mm a 300 ppi equivalen aproximadamente a 1.000 píxeles de ancho, mientras que 170 mm equivalen a unos 2.000 píxeles.
5. Seleccione un fondo transparente únicamente cuando la aplicación receptora lo admita y lo necesite; utilice blanco para obtener una apariencia predecible en procesadores de texto y flujos de trabajo de impresión.
6. Abra el PNG exportado al 100 % de su tamaño e inspeccione las etiquetas de átomos, las cargas, las cuñas estereoquímicas, las flechas y el texto pequeño.

Utilice 300 ppi como objetivo habitual de producción impresa cuando un editor lo especifique, pero las dimensiones en píxeles determinan el detalle rasterizado; el valor de ppi almacenado en un PNG afecta principalmente a su tamaño físico predeterminado en el software de maquetación. No amplíe un PNG pequeño después de exportarlo.

Otras opciones de conversión

Para la automatización, Open Babel puede leer muchos archivos CDX de ChemDraw y escribir una representación PNG cuando la compilación instalada incluye compatibilidad de salida con PNG/Cairo:

obabel input.cdx -O output.png --gen2d

--gen2d genera coordenadas bidimensionales cuando es necesario. Es posible que Open Babel no reproduzca exactamente las fuentes específicas de ChemDraw, el diseño de página, las flechas de reacción o las anotaciones complejas, por lo que debe utilizar ChemDraw para los gráficos destinados a publicaciones y comparar el resultado con el original.

CloudConvert y Zamzar ofrecen conversión de CDX a PNG mediante el navegador, pero confirme que el servicio identifica el archivo cargado como un archivo ChemDraw CDX y no como un formato de CorelDRAW. Cargue únicamente archivos no confidenciales; los servicios públicos de conversión no son adecuados para estructuras no publicadas, datos regulados o material de clientes, a menos que sus condiciones de privacidad y conservación cumplan la política requerida.

Para un archivo CDX antiguo de CorelDRAW, ábralo con la versión compatible de CorelDRAW o con un importador antiguo verificado y, a continuación, utilice File → Export para seleccionar PNG y establecer las dimensiones de píxeles. Por lo general, los editores de imágenes no abren directamente ninguna de las dos variantes de CDX.

Compatibilidad y límites de calidad

PNG no puede restaurarse a un archivo CDX químicamente editable sin volver a dibujarlo o utilizar reconocimiento de estructuras químicas. Las herramientas de reconocimiento pueden interpretar incorrectamente las etiquetas de átomos, las cargas, los órdenes de enlace y la estereoquímica.

Conserve el archivo .cdx original y exporte también un archivo PDF, SVG o EPS vectorial cuando el editor o el flujo de trabajo de impresión acepte gráficos vectoriales. Una exportación vectorial se escala sin rasterizar las líneas de enlace ni el texto, mientras que PNG es adecuado cuando se requiere un bitmap fijo.