Convertir CEL a XLS

Entendiendo los formatos de archivo CEL y XLS

CEL archivos se utilizan principalmente en el campo de la bioinformática y la genómica. Son generados por escáneres microarray de Affymetrix y contienen datos de intensidad en bruto de experimentos de expresión génica. Estos archivos no son hojas de cálculo, sino que almacenan datos científicos en un formato binario propietario.

XLS archivos son archivos de hojas de cálculo de Microsoft Excel. Almacenan datos en un formato tabular, soportando fórmulas, gráficos y formato, y son ampliamente utilizados para análisis de datos, informes y compartir información en tablas.

¿Por qué convertir CEL a XLS?

Convertir archivos CEL a formato XLS permite a investigadores y científicos analizar, visualizar y compartir datos de microarrays utilizando herramientas de hoja de cálculo familiares como Microsoft Excel. Esto facilita realizar análisis estadísticos, crear gráficos y colaborar con otros.

Cómo convertir CEL a XLS

Dado que los archivos CEL no son soportados nativamente por Excel, es necesario extraer los datos y reformatearlos en una hoja de cálculo. La mejor opción es utilizar software especializado en bioinformática para leer archivos CEL y exportar los datos a un formato compatible con Excel, como CSV, que luego puede guardarse como XLS.

Software recomendado para la conversión de CEL a XLS

• Affymetrix Expression Console: Esta herramienta gratuita de Thermo Fisher Scientific puede abrir archivos CEL y exportar datos procesados. Usa File → Exportar para guardar los resultados como un archivo CSV, que puedes abrir en Excel y luego guardar como XLS.
• R/Bioconductor: Los paquetes affy o oligo en R pueden leer archivos CEL. Después de procesar, usa R para escribir los datos en un archivo CSV con la función write.csv(), luego abre en Excel y guarda como XLS.
• GeneSpring: Este software comercial soporta archivos CEL y puede exportar tablas de datos directamente a formatos compatibles con Excel.

Proceso de conversión paso a paso

1. Abre tu archivo CEL en Affymetrix Expression Console o procésalo en R/Bioconductor.
2. Exporta los datos como un archivo CSV usando File → Exportar o el comando apropiado en R.
3. Abre el archivo CSV en Microsoft Excel.
4. Guarda el archivo como XLS usando File → Guardar como y seleccionando el formato de Libro de Excel.

Consejos para una conversión exitosa

• Asegúrate de tener el software correcto y las librerías necesarias instaladas.
• Verifica los datos exportados en busca de problemas de formato antes de guardar como XLS.
• Para conjuntos de datos grandes, considera usar el formato XLSX de Excel para un mejor rendimiento.